Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm50Q9D880 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm50Q9D880 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm50Q9D880 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm50Q9D880 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm50Q9D880 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm50Q9D880 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm50Q9D880 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm50Q9D880 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm50Q9D880 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timm50Q9D880 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timm50Q9D880 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm50Q9D880 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Timm50Q9D880 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Timm50Q9D880 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timm50Q9D880 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timm50Q9D880 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Timm50Q9D880 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Timm50Q9D880 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timm50Q9D880 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timm50Q9D880 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm50Q9D880 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm50Q9D880 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm50Q9D880 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timm50Q9D880 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm50Q9D880 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm50Q9D880 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm50Q9D880 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm50Q9D880 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timm50Q9D880 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Timm50Q9D880 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Timm50Q9D880 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Timm50Q9D880 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timm50Q9D880 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timm50Q9D880 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Timm50Q9D880 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Timm50Q9D880 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timm50Q9D880 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timm50Q9D880 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timm50Q9D880 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Timm50Q9D880 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms