Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Capns2Q9D7J7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Capns2Q9D7J7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Capns2Q9D7J7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capns2Q9D7J7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Capns2Q9D7J7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Capns2Q9D7J7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capns2Q9D7J7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Capns2Q9D7J7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Capns2Q9D7J7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Capns2Q9D7J7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Capns2Q9D7J7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Capns2Q9D7J7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Capns2Q9D7J7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capns2Q9D7J7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capns2Q9D7J7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capns2Q9D7J7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Capns2Q9D7J7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Capns2Q9D7J7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Capns2Q9D7J7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Capns2Q9D7J7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Capns2Q9D7J7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Capns2Q9D7J7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Capns2Q9D7J7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Capns2Q9D7J7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Capns2Q9D7J7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Capns2Q9D7J7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capns2Q9D7J7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capns2Q9D7J7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Capns2Q9D7J7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Capns2Q9D7J7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capns2Q9D7J7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capns2Q9D7J7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Capns2Q9D7J7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Capns2Q9D7J7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capns2Q9D7J7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Capns2Q9D7J7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Capns2Q9D7J7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Capns2Q9D7J7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capns2Q9D7J7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Capns2Q9D7J7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Capns2Q9D7J7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Capns2Q9D7J7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Capns2Q9D7J7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capns2Q9D7J7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Capns2Q9D7J7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Capns2Q9D7J7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Capns2Q9D7J7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Capns2Q9D7J7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capns2Q9D7J7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Capns2Q9D7J7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Capns2Q9D7J7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Capns2Q9D7J7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Capns2Q9D7J7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Capns2Q9D7J7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Capns2Q9D7J7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Capns2Q9D7J7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Capns2Q9D7J7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Capns2Q9D7J7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Capns2Q9D7J7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Capns2Q9D7J7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Capns2Q9D7J7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capns2Q9D7J7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capns2Q9D7J7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Capns2Q9D7J7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Capns2Q9D7J7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Capns2Q9D7J7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capns2Q9D7J7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Capns2Q9D7J7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Capns2Q9D7J7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Capns2Q9D7J7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capns2Q9D7J7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capns2Q9D7J7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capns2Q9D7J7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Capns2Q9D7J7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capns2Q9D7J7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capns2Q9D7J7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capns2Q9D7J7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capns2Q9D7J7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Capns2Q9D7J7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capns2Q9D7J7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms