Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc83Q9D4V3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc83Q9D4V3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc83Q9D4V3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc83Q9D4V3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc83Q9D4V3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc83Q9D4V3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc83Q9D4V3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc83Q9D4V3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc83Q9D4V3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc83Q9D4V3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc83Q9D4V3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc83Q9D4V3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc83Q9D4V3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc83Q9D4V3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc83Q9D4V3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc83Q9D4V3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc83Q9D4V3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc83Q9D4V3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc83Q9D4V3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc83Q9D4V3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc83Q9D4V3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc83Q9D4V3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc83Q9D4V3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc83Q9D4V3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc83Q9D4V3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc83Q9D4V3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc83Q9D4V3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc83Q9D4V3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc83Q9D4V3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc83Q9D4V3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc83Q9D4V3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc83Q9D4V3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc83Q9D4V3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc83Q9D4V3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc83Q9D4V3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc83Q9D4V3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc83Q9D4V3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc83Q9D4V3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc83Q9D4V3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms