Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933428M09RikQ9D3X3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933428M09RikQ9D3X3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933428M09RikQ9D3X3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933428M09RikQ9D3X3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933428M09RikQ9D3X3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933428M09RikQ9D3X3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933428M09RikQ9D3X3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933428M09RikQ9D3X3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933428M09RikQ9D3X3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933428M09RikQ9D3X3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4933428M09RikQ9D3X3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933428M09RikQ9D3X3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933428M09RikQ9D3X3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933428M09RikQ9D3X3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933428M09RikQ9D3X3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933428M09RikQ9D3X3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933428M09RikQ9D3X3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933428M09RikQ9D3X3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933428M09RikQ9D3X3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933428M09RikQ9D3X3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933428M09RikQ9D3X3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933428M09RikQ9D3X3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933428M09RikQ9D3X3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933428M09RikQ9D3X3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933428M09RikQ9D3X3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933428M09RikQ9D3X3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933428M09RikQ9D3X3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933428M09RikQ9D3X3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms