Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Snx29Q9D3S3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Snx29Q9D3S3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Snx29Q9D3S3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Snx29Q9D3S3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Snx29Q9D3S3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Snx29Q9D3S3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Snx29Q9D3S3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Snx29Q9D3S3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Snx29Q9D3S3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Snx29Q9D3S3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Snx29Q9D3S3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Snx29Q9D3S3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Snx29Q9D3S3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Snx29Q9D3S3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,33
Snx29Q9D3S3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Snx29Q9D3S3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Snx29Q9D3S3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Snx29Q9D3S3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Snx29Q9D3S3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Snx29Q9D3S3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Snx29Q9D3S3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,32
Snx29Q9D3S3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Snx29Q9D3S3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Snx29Q9D3S3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Snx29Q9D3S3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Snx29Q9D3S3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Snx29Q9D3S3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Snx29Q9D3S3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Snx29Q9D3S3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Snx29Q9D3S3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Snx29Q9D3S3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Snx29Q9D3S3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Snx29Q9D3S3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Snx29Q9D3S3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Snx29Q9D3S3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Snx29Q9D3S3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Snx29Q9D3S3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Snx29Q9D3S3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Snx29Q9D3S3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Snx29Q9D3S3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Snx29Q9D3S3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Snx29Q9D3S3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Snx29Q9D3S3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Snx29Q9D3S3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Snx29Q9D3S3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Snx29Q9D3S3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Snx29Q9D3S3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Snx29Q9D3S3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Snx29Q9D3S3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Snx29Q9D3S3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Snx29Q9D3S3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Snx29Q9D3S3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Snx29Q9D3S3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Snx29Q9D3S3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Snx29Q9D3S3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Snx29Q9D3S3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Snx29Q9D3S3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Snx29Q9D3S3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Snx29Q9D3S3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Snx29Q9D3S3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Snx29Q9D3S3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Snx29Q9D3S3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Snx29Q9D3S3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Snx29Q9D3S3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Snx29Q9D3S3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Snx29Q9D3S3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Snx29Q9D3S3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Snx29Q9D3S3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Snx29Q9D3S3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Snx29Q9D3S3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Snx29Q9D3S3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Snx29Q9D3S3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx29Q9D3S3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Snx29Q9D3S3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Snx29Q9D3S3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Snx29Q9D3S3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2,23
Snx29Q9D3S3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Snx29Q9D3S3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Snx29Q9D3S3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Snx29Q9D3S3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Snx29Q9D3S3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Snx29Q9D3S3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Snx29Q9D3S3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Snx29Q9D3S3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Snx29Q9D3S3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Snx29Q9D3S3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Snx29Q9D3S3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Snx29Q9D3S3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms