Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Z3

Fam173b, Protein FAM173B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173bQ9D1Z3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam173bQ9D1Z3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam173bQ9D1Z3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam173bQ9D1Z3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam173bQ9D1Z3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam173bQ9D1Z3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam173bQ9D1Z3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam173bQ9D1Z3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam173bQ9D1Z3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam173bQ9D1Z3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam173bQ9D1Z3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam173bQ9D1Z3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam173bQ9D1Z3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam173bQ9D1Z3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam173bQ9D1Z3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam173bQ9D1Z3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam173bQ9D1Z3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam173bQ9D1Z3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam173bQ9D1Z3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam173bQ9D1Z3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam173bQ9D1Z3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fam173bQ9D1Z3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam173bQ9D1Z3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam173bQ9D1Z3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam173bQ9D1Z3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam173bQ9D1Z3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam173bQ9D1Z3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam173bQ9D1Z3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam173bQ9D1Z3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam173bQ9D1Z3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam173bQ9D1Z3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam173bQ9D1Z3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam173bQ9D1Z3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam173bQ9D1Z3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam173bQ9D1Z3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam173bQ9D1Z3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam173bQ9D1Z3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam173bQ9D1Z3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam173bQ9D1Z3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam173bQ9D1Z3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam173bQ9D1Z3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam173bQ9D1Z3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam173bQ9D1Z3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam173bQ9D1Z3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam173bQ9D1Z3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam173bQ9D1Z3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam173bQ9D1Z3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam173bQ9D1Z3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam173bQ9D1Z3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam173bQ9D1Z3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam173bQ9D1Z3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam173bQ9D1Z3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam173bQ9D1Z3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam173bQ9D1Z3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam173bQ9D1Z3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam173bQ9D1Z3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam173bQ9D1Z3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam173bQ9D1Z3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam173bQ9D1Z3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fam173bQ9D1Z3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam173bQ9D1Z3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms