Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdm1Q9D067 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdm1Q9D067 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mdm1Q9D067 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdm1Q9D067 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdm1Q9D067 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdm1Q9D067 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdm1Q9D067 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mdm1Q9D067 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mdm1Q9D067 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdm1Q9D067 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdm1Q9D067 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdm1Q9D067 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdm1Q9D067 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdm1Q9D067 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdm1Q9D067 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdm1Q9D067 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdm1Q9D067 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdm1Q9D067 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdm1Q9D067 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdm1Q9D067 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdm1Q9D067 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdm1Q9D067 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdm1Q9D067 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdm1Q9D067 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdm1Q9D067 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdm1Q9D067 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm1Q9D067 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm1Q9D067 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdm1Q9D067 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdm1Q9D067 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdm1Q9D067 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mdm1Q9D067 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Mdm1Q9D067 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mdm1Q9D067 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mdm1Q9D067 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mdm1Q9D067 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mdm1Q9D067 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mdm1Q9D067 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mdm1Q9D067 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdm1Q9D067 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mdm1Q9D067 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mdm1Q9D067 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mdm1Q9D067 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mdm1Q9D067 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Mdm1Q9D067 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mdm1Q9D067 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mdm1Q9D067 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mdm1Q9D067 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mdm1Q9D067 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mdm1Q9D067 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mdm1Q9D067 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Mdm1Q9D067 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Mdm1Q9D067 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mdm1Q9D067 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Mdm1Q9D067 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mdm1Q9D067 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mdm1Q9D067 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mdm1Q9D067 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mdm1Q9D067 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Mdm1Q9D067 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mdm1Q9D067 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdm1Q9D067 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mdm1Q9D067 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdm1Q9D067 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdm1Q9D067 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdm1Q9D067 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm1Q9D067 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdm1Q9D067 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdm1Q9D067 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdm1Q9D067 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm1Q9D067 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm1Q9D067 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm1Q9D067 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm1Q9D067 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdm1Q9D067 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm1Q9D067 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mdm1Q9D067 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mdm1Q9D067 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mdm1Q9D067 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mdm1Q9D067 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mdm1Q9D067 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mdm1Q9D067 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mdm1Q9D067 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Mdm1Q9D067 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mdm1Q9D067 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mdm1Q9D067 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mdm1Q9D067 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mdm1Q9D067 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mdm1Q9D067 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mdm1Q9D067 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mdm1Q9D067 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms