Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srfbp1Q9CZ91 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srfbp1Q9CZ91 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Srfbp1Q9CZ91 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srfbp1Q9CZ91 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srfbp1Q9CZ91 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srfbp1Q9CZ91 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srfbp1Q9CZ91 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srfbp1Q9CZ91 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srfbp1Q9CZ91 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srfbp1Q9CZ91 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srfbp1Q9CZ91 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srfbp1Q9CZ91 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Srfbp1Q9CZ91 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Srfbp1Q9CZ91 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srfbp1Q9CZ91 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srfbp1Q9CZ91 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srfbp1Q9CZ91 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srfbp1Q9CZ91 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srfbp1Q9CZ91 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srfbp1Q9CZ91 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Srfbp1Q9CZ91 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srfbp1Q9CZ91 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Srfbp1Q9CZ91 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srfbp1Q9CZ91 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srfbp1Q9CZ91 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srfbp1Q9CZ91 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srfbp1Q9CZ91 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srfbp1Q9CZ91 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srfbp1Q9CZ91 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srfbp1Q9CZ91 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srfbp1Q9CZ91 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srfbp1Q9CZ91 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srfbp1Q9CZ91 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srfbp1Q9CZ91 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Srfbp1Q9CZ91 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srfbp1Q9CZ91 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srfbp1Q9CZ91 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srfbp1Q9CZ91 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srfbp1Q9CZ91 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srfbp1Q9CZ91 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srfbp1Q9CZ91 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srfbp1Q9CZ91 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srfbp1Q9CZ91 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srfbp1Q9CZ91 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srfbp1Q9CZ91 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srfbp1Q9CZ91 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srfbp1Q9CZ91 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srfbp1Q9CZ91 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srfbp1Q9CZ91 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms