Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmed5Q9CXE7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed5Q9CXE7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed5Q9CXE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed5Q9CXE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed5Q9CXE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed5Q9CXE7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed5Q9CXE7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed5Q9CXE7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed5Q9CXE7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed5Q9CXE7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed5Q9CXE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmed5Q9CXE7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmed5Q9CXE7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed5Q9CXE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed5Q9CXE7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmed5Q9CXE7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmed5Q9CXE7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmed5Q9CXE7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed5Q9CXE7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed5Q9CXE7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed5Q9CXE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmed5Q9CXE7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmed5Q9CXE7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmed5Q9CXE7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmed5Q9CXE7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmed5Q9CXE7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmed5Q9CXE7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmed5Q9CXE7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmed5Q9CXE7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmed5Q9CXE7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed5Q9CXE7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed5Q9CXE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms