Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxxc1Q9CWW7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxxc1Q9CWW7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cxxc1Q9CWW7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cxxc1Q9CWW7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cxxc1Q9CWW7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cxxc1Q9CWW7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cxxc1Q9CWW7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cxxc1Q9CWW7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxxc1Q9CWW7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cxxc1Q9CWW7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxxc1Q9CWW7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxxc1Q9CWW7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cxxc1Q9CWW7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cxxc1Q9CWW7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cxxc1Q9CWW7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cxxc1Q9CWW7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cxxc1Q9CWW7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cxxc1Q9CWW7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cxxc1Q9CWW7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cxxc1Q9CWW7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cxxc1Q9CWW7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cxxc1Q9CWW7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cxxc1Q9CWW7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cxxc1Q9CWW7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cxxc1Q9CWW7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cxxc1Q9CWW7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cxxc1Q9CWW7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cxxc1Q9CWW7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cxxc1Q9CWW7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cxxc1Q9CWW7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cxxc1Q9CWW7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cxxc1Q9CWW7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cxxc1Q9CWW7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cxxc1Q9CWW7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cxxc1Q9CWW7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cxxc1Q9CWW7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cxxc1Q9CWW7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cxxc1Q9CWW7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cxxc1Q9CWW7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cxxc1Q9CWW7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cxxc1Q9CWW7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cxxc1Q9CWW7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cxxc1Q9CWW7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cxxc1Q9CWW7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cxxc1Q9CWW7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxxc1Q9CWW7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cxxc1Q9CWW7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cxxc1Q9CWW7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxxc1Q9CWW7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cxxc1Q9CWW7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cxxc1Q9CWW7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cxxc1Q9CWW7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cxxc1Q9CWW7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cxxc1Q9CWW7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxxc1Q9CWW7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cxxc1Q9CWW7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cxxc1Q9CWW7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cxxc1Q9CWW7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cxxc1Q9CWW7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxxc1Q9CWW7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxxc1Q9CWW7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cxxc1Q9CWW7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cxxc1Q9CWW7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cxxc1Q9CWW7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cxxc1Q9CWW7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cxxc1Q9CWW7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cxxc1Q9CWW7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cxxc1Q9CWW7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxxc1Q9CWW7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxxc1Q9CWW7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cxxc1Q9CWW7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cxxc1Q9CWW7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cxxc1Q9CWW7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cxxc1Q9CWW7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cxxc1Q9CWW7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cxxc1Q9CWW7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cxxc1Q9CWW7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxxc1Q9CWW7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxxc1Q9CWW7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxxc1Q9CWW7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cxxc1Q9CWW7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cxxc1Q9CWW7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cxxc1Q9CWW7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cxxc1Q9CWW7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms