Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nrxn1Q9CS84 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Nrxn1Q9CS84 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Nrxn1Q9CS84 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Nrxn1Q9CS84 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Nrxn1Q9CS84 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Nrxn1Q9CS84 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Nrxn1Q9CS84 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Nrxn1Q9CS84 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nrxn1Q9CS84 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Nrxn1Q9CS84 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Nrxn1Q9CS84 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Nrxn1Q9CS84 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Nrxn1Q9CS84 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nrxn1Q9CS84 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nrxn1Q9CS84 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Nrxn1Q9CS84 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Nrxn1Q9CS84 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Nrxn1Q9CS84 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Nrxn1Q9CS84 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Nrxn1Q9CS84 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Nrxn1Q9CS84 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nrxn1Q9CS84 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nrxn1Q9CS84 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Nrxn1Q9CS84 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Nrxn1Q9CS84 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Nrxn1Q9CS84 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nrxn1Q9CS84 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nrxn1Q9CS84 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Nrxn1Q9CS84 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Nrxn1Q9CS84 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Nrxn1Q9CS84 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nrxn1Q9CS84 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Nrxn1Q9CS84 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nrxn1Q9CS84 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nrxn1Q9CS84 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nrxn1Q9CS84 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Nrxn1Q9CS84 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Nrxn1Q9CS84 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Nrxn1Q9CS84 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nrxn1Q9CS84 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nrxn1Q9CS84 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nrxn1Q9CS84 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Nrxn1Q9CS84 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Nrxn1Q9CS84 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nrxn1Q9CS84 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nrxn1Q9CS84 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nrxn1Q9CS84 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nrxn1Q9CS84 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Nrxn1Q9CS84 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Nrxn1Q9CS84 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Nrxn1Q9CS84 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Nrxn1Q9CS84 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Nrxn1Q9CS84 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Nrxn1Q9CS84 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Nrxn1Q9CS84 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nrxn1Q9CS84 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nrxn1Q9CS84 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nrxn1Q9CS84 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Nrxn1Q9CS84 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Nrxn1Q9CS84 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nrxn1Q9CS84 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Nrxn1Q9CS84 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Nrxn1Q9CS84 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nrxn1Q9CS84 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nrxn1Q9CS84 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Nrxn1Q9CS84 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Nrxn1Q9CS84 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nrxn1Q9CS84 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Nrxn1Q9CS84 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Nrxn1Q9CS84 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Nrxn1Q9CS84 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Nrxn1Q9CS84 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Nrxn1Q9CS84 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nrxn1Q9CS84 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nrxn1Q9CS84 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nrxn1Q9CS84 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nrxn1Q9CS84 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nrxn1Q9CS84 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nrxn1Q9CS84 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Nrxn1Q9CS84 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Nrxn1Q9CS84 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Nrxn1Q9CS84 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Nrxn1Q9CS84 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Nrxn1Q9CS84 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nrxn1Q9CS84 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nrxn1Q9CS84 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Nrxn1Q9CS84 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nrxn1Q9CS84 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms