Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700029F12RikQ9CRB4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700029F12RikQ9CRB4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700029F12RikQ9CRB4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700029F12RikQ9CRB4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700029F12RikQ9CRB4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700029F12RikQ9CRB4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700029F12RikQ9CRB4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700029F12RikQ9CRB4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
1700029F12RikQ9CRB4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700029F12RikQ9CRB4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700029F12RikQ9CRB4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700029F12RikQ9CRB4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700029F12RikQ9CRB4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700029F12RikQ9CRB4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1700029F12RikQ9CRB4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700029F12RikQ9CRB4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700029F12RikQ9CRB4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700029F12RikQ9CRB4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700029F12RikQ9CRB4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700029F12RikQ9CRB4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700029F12RikQ9CRB4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700029F12RikQ9CRB4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700029F12RikQ9CRB4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700029F12RikQ9CRB4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700029F12RikQ9CRB4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700029F12RikQ9CRB4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700029F12RikQ9CRB4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700029F12RikQ9CRB4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms