Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN1

Trap1, Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1Q9CQN1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trap1Q9CQN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trap1Q9CQN1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trap1Q9CQN1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trap1Q9CQN1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trap1Q9CQN1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trap1Q9CQN1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trap1Q9CQN1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trap1Q9CQN1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Trap1Q9CQN1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trap1Q9CQN1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trap1Q9CQN1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trap1Q9CQN1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trap1Q9CQN1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trap1Q9CQN1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trap1Q9CQN1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trap1Q9CQN1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trap1Q9CQN1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trap1Q9CQN1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trap1Q9CQN1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trap1Q9CQN1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trap1Q9CQN1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trap1Q9CQN1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trap1Q9CQN1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trap1Q9CQN1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trap1Q9CQN1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trap1Q9CQN1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trap1Q9CQN1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trap1Q9CQN1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trap1Q9CQN1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trap1Q9CQN1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trap1Q9CQN1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trap1Q9CQN1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trap1Q9CQN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trap1Q9CQN1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trap1Q9CQN1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Trap1Q9CQN1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trap1Q9CQN1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trap1Q9CQN1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms