Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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