Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39lQ9CQD0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39lQ9CQD0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39lQ9CQD0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms