Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Rassf3Q99P51 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Rassf3Q99P51 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Rassf3Q99P51 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Rassf3Q99P51 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Rassf3Q99P51 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Rassf3Q99P51 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rassf3Q99P51 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Rassf3Q99P51 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rassf3Q99P51 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Rassf3Q99P51 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rassf3Q99P51 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rassf3Q99P51 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rassf3Q99P51 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Rassf3Q99P51 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Rassf3Q99P51 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Rassf3Q99P51 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rassf3Q99P51 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Rassf3Q99P51 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Rassf3Q99P51 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Rassf3Q99P51 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Rassf3Q99P51 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Rassf3Q99P51 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Rassf3Q99P51 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Rassf3Q99P51 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rassf3Q99P51 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rassf3Q99P51 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Rassf3Q99P51 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rassf3Q99P51 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rassf3Q99P51 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rassf3Q99P51 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Rassf3Q99P51 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rassf3Q99P51 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Rassf3Q99P51 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Rassf3Q99P51 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rassf3Q99P51 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rassf3Q99P51 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rassf3Q99P51 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Rassf3Q99P51 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Rassf3Q99P51 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Rassf3Q99P51 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Rassf3Q99P51 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Rassf3Q99P51 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Rassf3Q99P51 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rassf3Q99P51 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rassf3Q99P51 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rassf3Q99P51 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rassf3Q99P51 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Rassf3Q99P51 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rassf3Q99P51 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rassf3Q99P51 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Rassf3Q99P51 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Rassf3Q99P51 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Rassf3Q99P51 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rassf3Q99P51 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rassf3Q99P51 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rassf3Q99P51 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,25
Rassf3Q99P51 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rassf3Q99P51 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rassf3Q99P51 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Rassf3Q99P51 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Rassf3Q99P51 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Rassf3Q99P51 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rassf3Q99P51 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Rassf3Q99P51 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Rassf3Q99P51 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Rassf3Q99P51 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Rassf3Q99P51 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rassf3Q99P51 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rassf3Q99P51 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Rassf3Q99P51 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Rassf3Q99P51 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Rassf3Q99P51 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Rassf3Q99P51 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Rassf3Q99P51 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Rassf3Q99P51 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Rassf3Q99P51 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rassf3Q99P51 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rassf3Q99P51 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rassf3Q99P51 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rassf3Q99P51 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Rassf3Q99P51 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Rassf3Q99P51 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Rassf3Q99P51 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Rassf3Q99P51 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Rassf3Q99P51 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Rassf3Q99P51 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rassf3Q99P51 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rassf3Q99P51 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Rassf3Q99P51 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rassf3Q99P51 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rassf3Q99P51 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms