Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atoh8Q99NA2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atoh8Q99NA2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atoh8Q99NA2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atoh8Q99NA2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atoh8Q99NA2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atoh8Q99NA2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atoh8Q99NA2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atoh8Q99NA2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atoh8Q99NA2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atoh8Q99NA2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atoh8Q99NA2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atoh8Q99NA2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atoh8Q99NA2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atoh8Q99NA2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atoh8Q99NA2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atoh8Q99NA2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atoh8Q99NA2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atoh8Q99NA2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atoh8Q99NA2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atoh8Q99NA2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atoh8Q99NA2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atoh8Q99NA2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atoh8Q99NA2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atoh8Q99NA2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atoh8Q99NA2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atoh8Q99NA2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atoh8Q99NA2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atoh8Q99NA2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atoh8Q99NA2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atoh8Q99NA2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atoh8Q99NA2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atoh8Q99NA2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atoh8Q99NA2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atoh8Q99NA2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh8Q99NA2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atoh8Q99NA2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atoh8Q99NA2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atoh8Q99NA2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atoh8Q99NA2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atoh8Q99NA2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atoh8Q99NA2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atoh8Q99NA2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atoh8Q99NA2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atoh8Q99NA2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh8Q99NA2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atoh8Q99NA2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atoh8Q99NA2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atoh8Q99NA2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atoh8Q99NA2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Atoh8Q99NA2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atoh8Q99NA2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atoh8Q99NA2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atoh8Q99NA2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atoh8Q99NA2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atoh8Q99NA2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atoh8Q99NA2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atoh8Q99NA2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atoh8Q99NA2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atoh8Q99NA2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atoh8Q99NA2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Atoh8Q99NA2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh8Q99NA2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atoh8Q99NA2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atoh8Q99NA2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atoh8Q99NA2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atoh8Q99NA2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atoh8Q99NA2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atoh8Q99NA2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms