Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bbc3Q99ML1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bbc3Q99ML1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bbc3Q99ML1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbc3Q99ML1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbc3Q99ML1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bbc3Q99ML1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bbc3Q99ML1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbc3Q99ML1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bbc3Q99ML1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bbc3Q99ML1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbc3Q99ML1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbc3Q99ML1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bbc3Q99ML1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bbc3Q99ML1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbc3Q99ML1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bbc3Q99ML1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbc3Q99ML1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbc3Q99ML1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbc3Q99ML1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbc3Q99ML1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bbc3Q99ML1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbc3Q99ML1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbc3Q99ML1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbc3Q99ML1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbc3Q99ML1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbc3Q99ML1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbc3Q99ML1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbc3Q99ML1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbc3Q99ML1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbc3Q99ML1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbc3Q99ML1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbc3Q99ML1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bbc3Q99ML1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbc3Q99ML1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbc3Q99ML1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbc3Q99ML1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbc3Q99ML1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbc3Q99ML1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbc3Q99ML1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbc3Q99ML1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbc3Q99ML1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbc3Q99ML1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbc3Q99ML1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bbc3Q99ML1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bbc3Q99ML1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbc3Q99ML1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bbc3Q99ML1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bbc3Q99ML1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bbc3Q99ML1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bbc3Q99ML1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bbc3Q99ML1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bbc3Q99ML1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bbc3Q99ML1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms