Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpifQ99KR7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpifQ99KR7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PpifQ99KR7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PpifQ99KR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpifQ99KR7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PpifQ99KR7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpifQ99KR7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PpifQ99KR7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpifQ99KR7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpifQ99KR7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpifQ99KR7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpifQ99KR7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpifQ99KR7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PpifQ99KR7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpifQ99KR7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpifQ99KR7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpifQ99KR7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpifQ99KR7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpifQ99KR7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PpifQ99KR7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpifQ99KR7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PpifQ99KR7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms