Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sdcbp2Q99JZ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sdcbp2Q99JZ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sdcbp2Q99JZ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sdcbp2Q99JZ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sdcbp2Q99JZ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sdcbp2Q99JZ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sdcbp2Q99JZ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sdcbp2Q99JZ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sdcbp2Q99JZ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sdcbp2Q99JZ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sdcbp2Q99JZ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sdcbp2Q99JZ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sdcbp2Q99JZ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sdcbp2Q99JZ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sdcbp2Q99JZ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sdcbp2Q99JZ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sdcbp2Q99JZ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sdcbp2Q99JZ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdcbp2Q99JZ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sdcbp2Q99JZ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sdcbp2Q99JZ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sdcbp2Q99JZ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sdcbp2Q99JZ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sdcbp2Q99JZ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdcbp2Q99JZ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sdcbp2Q99JZ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sdcbp2Q99JZ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sdcbp2Q99JZ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sdcbp2Q99JZ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sdcbp2Q99JZ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sdcbp2Q99JZ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sdcbp2Q99JZ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sdcbp2Q99JZ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sdcbp2Q99JZ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sdcbp2Q99JZ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sdcbp2Q99JZ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sdcbp2Q99JZ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sdcbp2Q99JZ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sdcbp2Q99JZ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sdcbp2Q99JZ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sdcbp2Q99JZ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sdcbp2Q99JZ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sdcbp2Q99JZ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sdcbp2Q99JZ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sdcbp2Q99JZ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sdcbp2Q99JZ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sdcbp2Q99JZ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sdcbp2Q99JZ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sdcbp2Q99JZ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sdcbp2Q99JZ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sdcbp2Q99JZ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sdcbp2Q99JZ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sdcbp2Q99JZ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sdcbp2Q99JZ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sdcbp2Q99JZ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms