Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Sfxn1Q99JR1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sfxn1Q99JR1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Sfxn1Q99JR1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sfxn1Q99JR1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sfxn1Q99JR1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sfxn1Q99JR1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sfxn1Q99JR1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sfxn1Q99JR1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sfxn1Q99JR1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sfxn1Q99JR1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sfxn1Q99JR1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sfxn1Q99JR1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sfxn1Q99JR1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sfxn1Q99JR1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sfxn1Q99JR1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sfxn1Q99JR1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sfxn1Q99JR1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sfxn1Q99JR1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sfxn1Q99JR1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sfxn1Q99JR1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sfxn1Q99JR1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sfxn1Q99JR1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sfxn1Q99JR1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sfxn1Q99JR1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sfxn1Q99JR1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sfxn1Q99JR1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sfxn1Q99JR1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sfxn1Q99JR1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sfxn1Q99JR1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sfxn1Q99JR1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sfxn1Q99JR1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sfxn1Q99JR1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sfxn1Q99JR1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sfxn1Q99JR1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sfxn1Q99JR1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sfxn1Q99JR1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sfxn1Q99JR1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sfxn1Q99JR1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sfxn1Q99JR1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sfxn1Q99JR1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sfxn1Q99JR1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sfxn1Q99JR1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sfxn1Q99JR1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sfxn1Q99JR1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sfxn1Q99JR1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sfxn1Q99JR1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sfxn1Q99JR1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sfxn1Q99JR1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sfxn1Q99JR1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sfxn1Q99JR1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sfxn1Q99JR1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sfxn1Q99JR1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sfxn1Q99JR1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sfxn1Q99JR1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sfxn1Q99JR1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sfxn1Q99JR1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sfxn1Q99JR1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sfxn1Q99JR1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sfxn1Q99JR1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sfxn1Q99JR1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sfxn1Q99JR1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sfxn1Q99JR1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sfxn1Q99JR1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms