Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
SncbQ91ZZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
SncbQ91ZZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
SncbQ91ZZ3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
SncbQ91ZZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
SncbQ91ZZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
SncbQ91ZZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,68■■□□□ 1,7
SncbQ91ZZ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SncbQ91ZZ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SncbQ91ZZ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
SncbQ91ZZ3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
SncbQ91ZZ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
SncbQ91ZZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
SncbQ91ZZ3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
SncbQ91ZZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,52■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
SncbQ91ZZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
SncbQ91ZZ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
SncbQ91ZZ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
SncbQ91ZZ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
SncbQ91ZZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
SncbQ91ZZ3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
SncbQ91ZZ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
SncbQ91ZZ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
SncbQ91ZZ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
SncbQ91ZZ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
SncbQ91ZZ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
SncbQ91ZZ3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
SncbQ91ZZ3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
SncbQ91ZZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
SncbQ91ZZ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
SncbQ91ZZ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
SncbQ91ZZ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
SncbQ91ZZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
SncbQ91ZZ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
SncbQ91ZZ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
SncbQ91ZZ3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
SncbQ91ZZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
SncbQ91ZZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,7 ms