Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zkscan3Q91VW9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zkscan3Q91VW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zkscan3Q91VW9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zkscan3Q91VW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zkscan3Q91VW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zkscan3Q91VW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zkscan3Q91VW9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zkscan3Q91VW9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Zkscan3Q91VW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zkscan3Q91VW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zkscan3Q91VW9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zkscan3Q91VW9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zkscan3Q91VW9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Zkscan3Q91VW9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zkscan3Q91VW9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan3Q91VW9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan3Q91VW9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan3Q91VW9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zkscan3Q91VW9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zkscan3Q91VW9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zkscan3Q91VW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zkscan3Q91VW9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zkscan3Q91VW9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan3Q91VW9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan3Q91VW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan3Q91VW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan3Q91VW9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan3Q91VW9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan3Q91VW9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zkscan3Q91VW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zkscan3Q91VW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zkscan3Q91VW9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zkscan3Q91VW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zkscan3Q91VW9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zkscan3Q91VW9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zkscan3Q91VW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zkscan3Q91VW9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zkscan3Q91VW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zkscan3Q91VW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zkscan3Q91VW9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zkscan3Q91VW9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zkscan3Q91VW9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zkscan3Q91VW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Zkscan3Q91VW9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zkscan3Q91VW9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zkscan3Q91VW9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zkscan3Q91VW9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zkscan3Q91VW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zkscan3Q91VW9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zkscan3Q91VW9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan3Q91VW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zkscan3Q91VW9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan3Q91VW9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zkscan3Q91VW9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zkscan3Q91VW9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zkscan3Q91VW9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zkscan3Q91VW9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zkscan3Q91VW9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zkscan3Q91VW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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