Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrl3Q91VW3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrl3Q91VW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms