Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Cul7Q8VE73 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,64■■■■■ 4,26
Cul7Q8VE73 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Cul7Q8VE73 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41,6■■■■■ 4,25
Cul7Q8VE73 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Cul7Q8VE73 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,56■■■■■ 4,24
Cul7Q8VE73 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Cul7Q8VE73 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC41,53■■■■■ 4,24
Cul7Q8VE73 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,53■■■■■ 4,24
Cul7Q8VE73 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Cul7Q8VE73 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Cul7Q8VE73 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Cul7Q8VE73 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Cul7Q8VE73 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41,44■■■■■ 4,22
Cul7Q8VE73 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Cul7Q8VE73 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Cul7Q8VE73 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,38■■■■■ 4,22
Cul7Q8VE73 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Cul7Q8VE73 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
Cul7Q8VE73 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC41,3■■■■■ 4,2
Cul7Q8VE73 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
Cul7Q8VE73 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41,3■■■■■ 4,2
Cul7Q8VE73 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41,26■■■■■ 4,2
Cul7Q8VE73 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,2
Cul7Q8VE73 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,25■■■■■ 4,19
Cul7Q8VE73 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Cul7Q8VE73 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Cul7Q8VE73 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Cul7Q8VE73 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Cul7Q8VE73 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Cul7Q8VE73 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Cul7Q8VE73 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
Cul7Q8VE73 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41,17■■■■■ 4,18
Cul7Q8VE73 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41,17■■■■■ 4,18
Cul7Q8VE73 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41,16■■■■■ 4,18
Cul7Q8VE73 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Cul7Q8VE73 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Cul7Q8VE73 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,09■■■■■ 4,17
Cul7Q8VE73 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Cul7Q8VE73 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,07■■■■■ 4,17
Cul7Q8VE73 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41,07■■■■■ 4,17
Cul7Q8VE73 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Cul7Q8VE73 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Cul7Q8VE73 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Cul7Q8VE73 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,04■■■■■ 4,16
Cul7Q8VE73 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
Cul7Q8VE73 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Cul7Q8VE73 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
Cul7Q8VE73 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
Cul7Q8VE73 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Cul7Q8VE73 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Cul7Q8VE73 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40,97■■■■■ 4,15
Cul7Q8VE73 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC40,97■■■■■ 4,15
Cul7Q8VE73 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Cul7Q8VE73 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40,94■■■■■ 4,14
Cul7Q8VE73 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40,91■■■■■ 4,14
Cul7Q8VE73 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40,89■■■■■ 4,14
Cul7Q8VE73 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40,87■■■■■ 4,13
Cul7Q8VE73 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40,85■■■■■ 4,13
Cul7Q8VE73 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Cul7Q8VE73 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Cul7Q8VE73 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Cul7Q8VE73 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC40,79■■■■■ 4,12
Cul7Q8VE73 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Cul7Q8VE73 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Cul7Q8VE73 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40,72■■■■■ 4,11
Cul7Q8VE73 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Cul7Q8VE73 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Cul7Q8VE73 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Cul7Q8VE73 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Cul7Q8VE73 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC40,7■■■■■ 4,11
Cul7Q8VE73 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Cul7Q8VE73 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Cul7Q8VE73 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
Cul7Q8VE73 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Cul7Q8VE73 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
Cul7Q8VE73 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Cul7Q8VE73 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Cul7Q8VE73 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40,42■■■■■ 4,06
Cul7Q8VE73 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Cul7Q8VE73 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40,37■■■■■ 4,05
Cul7Q8VE73 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Cul7Q8VE73 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Cul7Q8VE73 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Cul7Q8VE73 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40,27■■■■■ 4,04
Cul7Q8VE73 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Cul7Q8VE73 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Cul7Q8VE73 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Cul7Q8VE73 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
Cul7Q8VE73 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Cul7Q8VE73 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Cul7Q8VE73 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Cul7Q8VE73 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,18■■■■■ 4,02
Cul7Q8VE73 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40,18■■■■■ 4,02
Cul7Q8VE73 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Cul7Q8VE73 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Cul7Q8VE73 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,16■■■■■ 4,02
Cul7Q8VE73 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40,15■■■■■ 4,02
Cul7Q8VE73 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,15■■■■■ 4,02
Cul7Q8VE73 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms