Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCM7

Fgg, Fibrinogen gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FggQ8VCM7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FggQ8VCM7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FggQ8VCM7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FggQ8VCM7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FggQ8VCM7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FggQ8VCM7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FggQ8VCM7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FggQ8VCM7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FggQ8VCM7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FggQ8VCM7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FggQ8VCM7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FggQ8VCM7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FggQ8VCM7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FggQ8VCM7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FggQ8VCM7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FggQ8VCM7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FggQ8VCM7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FggQ8VCM7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FggQ8VCM7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FggQ8VCM7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FggQ8VCM7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FggQ8VCM7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FggQ8VCM7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FggQ8VCM7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FggQ8VCM7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FggQ8VCM7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FggQ8VCM7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FggQ8VCM7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FggQ8VCM7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FggQ8VCM7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FggQ8VCM7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FggQ8VCM7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FggQ8VCM7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FggQ8VCM7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FggQ8VCM7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FggQ8VCM7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FggQ8VCM7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FggQ8VCM7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FggQ8VCM7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FggQ8VCM7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FggQ8VCM7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FggQ8VCM7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FggQ8VCM7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FggQ8VCM7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FggQ8VCM7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FggQ8VCM7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FggQ8VCM7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FggQ8VCM7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FggQ8VCM7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FggQ8VCM7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FggQ8VCM7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FggQ8VCM7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FggQ8VCM7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FggQ8VCM7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FggQ8VCM7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FggQ8VCM7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FggQ8VCM7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FggQ8VCM7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FggQ8VCM7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FggQ8VCM7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FggQ8VCM7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms