Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ApobrQ8VBT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ApobrQ8VBT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ApobrQ8VBT6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ApobrQ8VBT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ApobrQ8VBT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ApobrQ8VBT6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ApobrQ8VBT6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ApobrQ8VBT6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ApobrQ8VBT6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ApobrQ8VBT6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ApobrQ8VBT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ApobrQ8VBT6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ApobrQ8VBT6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ApobrQ8VBT6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ApobrQ8VBT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ApobrQ8VBT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ApobrQ8VBT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ApobrQ8VBT6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ApobrQ8VBT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ApobrQ8VBT6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ApobrQ8VBT6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ApobrQ8VBT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ApobrQ8VBT6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ApobrQ8VBT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ApobrQ8VBT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ApobrQ8VBT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ApobrQ8VBT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ApobrQ8VBT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ApobrQ8VBT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ApobrQ8VBT6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ApobrQ8VBT6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ApobrQ8VBT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ApobrQ8VBT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ApobrQ8VBT6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ApobrQ8VBT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ApobrQ8VBT6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ApobrQ8VBT6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ApobrQ8VBT6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ApobrQ8VBT6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ApobrQ8VBT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ApobrQ8VBT6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ApobrQ8VBT6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ApobrQ8VBT6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ApobrQ8VBT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ApobrQ8VBT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ApobrQ8VBT6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ApobrQ8VBT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ApobrQ8VBT6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ApobrQ8VBT6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ApobrQ8VBT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ApobrQ8VBT6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ApobrQ8VBT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ApobrQ8VBT6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ApobrQ8VBT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ApobrQ8VBT6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ApobrQ8VBT6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ApobrQ8VBT6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ApobrQ8VBT6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ApobrQ8VBT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ApobrQ8VBT6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ApobrQ8VBT6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ApobrQ8VBT6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ApobrQ8VBT6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ApobrQ8VBT6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ApobrQ8VBT6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ApobrQ8VBT6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ApobrQ8VBT6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ApobrQ8VBT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ApobrQ8VBT6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ApobrQ8VBT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ApobrQ8VBT6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ApobrQ8VBT6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ApobrQ8VBT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ApobrQ8VBT6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ApobrQ8VBT6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms