Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
ApobrQ8VBT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
ApobrQ8VBT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
ApobrQ8VBT6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
ApobrQ8VBT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
ApobrQ8VBT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
ApobrQ8VBT6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
ApobrQ8VBT6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34,42■■■■□ 3,1
ApobrQ8VBT6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
ApobrQ8VBT6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
ApobrQ8VBT6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
ApobrQ8VBT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
ApobrQ8VBT6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
ApobrQ8VBT6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,38■■■■□ 3,09
ApobrQ8VBT6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34,37■■■■□ 3,09
ApobrQ8VBT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34,36■■■■□ 3,09
ApobrQ8VBT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
ApobrQ8VBT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
ApobrQ8VBT6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
ApobrQ8VBT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
ApobrQ8VBT6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
ApobrQ8VBT6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
ApobrQ8VBT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
ApobrQ8VBT6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
ApobrQ8VBT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
ApobrQ8VBT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
ApobrQ8VBT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
ApobrQ8VBT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
ApobrQ8VBT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
ApobrQ8VBT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34,12■■■■□ 3,05
ApobrQ8VBT6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
ApobrQ8VBT6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
ApobrQ8VBT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
ApobrQ8VBT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
ApobrQ8VBT6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
ApobrQ8VBT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
ApobrQ8VBT6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
ApobrQ8VBT6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34,01■■■■□ 3,03
ApobrQ8VBT6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
ApobrQ8VBT6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
ApobrQ8VBT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,97■■■■□ 3,03
ApobrQ8VBT6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33,96■■■■□ 3,03
ApobrQ8VBT6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
ApobrQ8VBT6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
ApobrQ8VBT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
ApobrQ8VBT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
ApobrQ8VBT6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
ApobrQ8VBT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
ApobrQ8VBT6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
ApobrQ8VBT6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33,86■■■■□ 3,01
ApobrQ8VBT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
ApobrQ8VBT6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,81■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33,78■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33,77■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
ApobrQ8VBT6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
ApobrQ8VBT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
ApobrQ8VBT6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33,69■■■□□ 2,98
ApobrQ8VBT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
ApobrQ8VBT6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
ApobrQ8VBT6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
ApobrQ8VBT6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
ApobrQ8VBT6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
ApobrQ8VBT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
ApobrQ8VBT6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
ApobrQ8VBT6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,63■■■□□ 2,97
ApobrQ8VBT6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
ApobrQ8VBT6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33,62■■■□□ 2,97
ApobrQ8VBT6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
ApobrQ8VBT6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33,61■■■□□ 2,97
ApobrQ8VBT6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
ApobrQ8VBT6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,59■■■□□ 2,97
ApobrQ8VBT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
ApobrQ8VBT6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
ApobrQ8VBT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
ApobrQ8VBT6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33,5■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,49■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33,46■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33,45■■■□□ 2,95
ApobrQ8VBT6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
ApobrQ8VBT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
ApobrQ8VBT6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
ApobrQ8VBT6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms