Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610009B22RikQ8R3W2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
0610009B22RikQ8R3W2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
0610009B22RikQ8R3W2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
0610009B22RikQ8R3W2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
0610009B22RikQ8R3W2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
0610009B22RikQ8R3W2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
0610009B22RikQ8R3W2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
0610009B22RikQ8R3W2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
0610009B22RikQ8R3W2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
0610009B22RikQ8R3W2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
0610009B22RikQ8R3W2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
0610009B22RikQ8R3W2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.3■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
0610009B22RikQ8R3W2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610009B22RikQ8R3W2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
0610009B22RikQ8R3W2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610009B22RikQ8R3W2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610009B22RikQ8R3W2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
0610009B22RikQ8R3W2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
0610009B22RikQ8R3W2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
0610009B22RikQ8R3W2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
0610009B22RikQ8R3W2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
0610009B22RikQ8R3W2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
0610009B22RikQ8R3W2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms