Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC48,15■■■■■ 5,3
Cc2d2aQ8CFW7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48,13■■■■■ 5,29
Cc2d2aQ8CFW7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,11■■■■■ 5,29
Cc2d2aQ8CFW7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,1■■■■■ 5,29
Cc2d2aQ8CFW7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC48,1■■■■■ 5,29
Cc2d2aQ8CFW7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,1■■■■■ 5,29
Cc2d2aQ8CFW7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,07■■■■■ 5,29
Cc2d2aQ8CFW7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,05■■■■■ 5,28
Cc2d2aQ8CFW7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48,04■■■■■ 5,28
Cc2d2aQ8CFW7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC48,03■■■■■ 5,28
Cc2d2aQ8CFW7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC48,01■■■■■ 5,28
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5,28
Cc2d2aQ8CFW7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,96■■■■■ 5,27
Cc2d2aQ8CFW7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,96■■■■■ 5,27
Cc2d2aQ8CFW7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC47,96■■■■■ 5,27
Cc2d2aQ8CFW7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47,95■■■■■ 5,27
Cc2d2aQ8CFW7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC47,93■■■■■ 5,26
Cc2d2aQ8CFW7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC47,92■■■■■ 5,26
Cc2d2aQ8CFW7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,89■■■■■ 5,26
Cc2d2aQ8CFW7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC47,89■■■■■ 5,26
Cc2d2aQ8CFW7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,87■■■■■ 5,25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47,87■■■■■ 5,25
Cc2d2aQ8CFW7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47,85■■■■■ 5,25
Cc2d2aQ8CFW7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,84■■■■■ 5,25
Cc2d2aQ8CFW7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47,74■■■■■ 5,23
Cc2d2aQ8CFW7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47,72■■■■■ 5,23
Cc2d2aQ8CFW7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC47,71■■■■■ 5,23
Cc2d2aQ8CFW7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47,7■■■■■ 5,23
Cc2d2aQ8CFW7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC47,69■■■■■ 5,22
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC47,67■■■■■ 5,22
Cc2d2aQ8CFW7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC47,64■■■■■ 5,22
Cc2d2aQ8CFW7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC47,63■■■■■ 5,22
Cc2d2aQ8CFW7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,61■■■■■ 5,21
Cc2d2aQ8CFW7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC47,6■■■■■ 5,21
Cc2d2aQ8CFW7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC47,59■■■■■ 5,21
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,57■■■■■ 5,2
Cc2d2aQ8CFW7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,55■■■■■ 5,2
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC47,55■■■■■ 5,2
Cc2d2aQ8CFW7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,52■■■■■ 5,2
Cc2d2aQ8CFW7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,5■■■■■ 5,19
Cc2d2aQ8CFW7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC47,48■■■■■ 5,19
Cc2d2aQ8CFW7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,48■■■■■ 5,19
Cc2d2aQ8CFW7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,47■■■■■ 5,19
Cc2d2aQ8CFW7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC47,43■■■■■ 5,18
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC47,41■■■■■ 5,18
Cc2d2aQ8CFW7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC47,35■■■■■ 5,17
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC47,32■■■■■ 5,17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC47,28■■■■■ 5,16
Cc2d2aQ8CFW7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC47,22■■■■■ 5,15
Cc2d2aQ8CFW7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC47,19■■■■■ 5,15
Cc2d2aQ8CFW7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC47,19■■■■■ 5,14
Cc2d2aQ8CFW7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,18■■■■■ 5,14
Cc2d2aQ8CFW7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,17■■■■■ 5,14
Cc2d2aQ8CFW7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,16■■■■■ 5,14
Cc2d2aQ8CFW7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,12■■■■■ 5,13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC47,08■■■■■ 5,13
Cc2d2aQ8CFW7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,06■■■■■ 5,12
Cc2d2aQ8CFW7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC47,05■■■■■ 5,12
Cc2d2aQ8CFW7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,03■■■■■ 5,12
Cc2d2aQ8CFW7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47,03■■■■■ 5,12
Cc2d2aQ8CFW7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,03■■■■■ 5,12
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC47■■■■■ 5,11
Cc2d2aQ8CFW7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,96■■■■■ 5,11
Cc2d2aQ8CFW7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC46,94■■■■■ 5,1
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC46,91■■■■■ 5,1
Cc2d2aQ8CFW7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC46,89■■■■■ 5,1
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,83■■■■■ 5,09
Cc2d2aQ8CFW7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,81■■■■■ 5,08
Cc2d2aQ8CFW7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,78■■■■■ 5,08
Cc2d2aQ8CFW7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,72■■■■■ 5,07
Cc2d2aQ8CFW7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,7■■■■■ 5,07
Cc2d2aQ8CFW7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,63■■■■■ 5,06
Cc2d2aQ8CFW7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC46,63■■■■■ 5,05
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC46,61■■■■■ 5,05
Cc2d2aQ8CFW7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,55■■■■■ 5,04
Cc2d2aQ8CFW7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC46,49■■■■■ 5,03
Cc2d2aQ8CFW7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,41■■■■■ 5,02
Cc2d2aQ8CFW7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC46,41■■■■■ 5,02
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,41■■■■■ 5,02
Cc2d2aQ8CFW7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46,4■■■■■ 5,02
Cc2d2aQ8CFW7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC46,35■■■■■ 5,01
Cc2d2aQ8CFW7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC46,35■■■■■ 5,01
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46,35■■■■■ 5,01
Cc2d2aQ8CFW7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC46,35■■■■■ 5,01
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,33■■■■■ 5,01
Cc2d2aQ8CFW7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC46,33■■■■■ 5,01
Cc2d2aQ8CFW7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC46,33■■■■■ 5,01
Cc2d2aQ8CFW7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC46,32■■■■■ 5,01
Cc2d2aQ8CFW7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,31■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,29■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,28■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,27■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC46,27■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46,26■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC46,24■■■■■ 4,99
Cc2d2aQ8CFW7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,22■■■■■ 4,99
Cc2d2aQ8CFW7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46,19■■■■■ 4,98
Cc2d2aQ8CFW7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46,19■■■■■ 4,98
Cc2d2aQ8CFW7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC46,17■■■■■ 4,98
Cc2d2aQ8CFW7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC46,16■■■■■ 4,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms