Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
Cc2d2aQ8CFW7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.29
Cc2d2aQ8CFW7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Cc2d2aQ8CFW7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
Cc2d2aQ8CFW7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC48.1■■■■■ 5.29
Cc2d2aQ8CFW7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
Cc2d2aQ8CFW7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Cc2d2aQ8CFW7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
Cc2d2aQ8CFW7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
Cc2d2aQ8CFW7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
Cc2d2aQ8CFW7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC48.01■■■■■ 5.28
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
Cc2d2aQ8CFW7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Cc2d2aQ8CFW7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Cc2d2aQ8CFW7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Cc2d2aQ8CFW7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
Cc2d2aQ8CFW7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Cc2d2aQ8CFW7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Cc2d2aQ8CFW7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Cc2d2aQ8CFW7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Cc2d2aQ8CFW7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
Cc2d2aQ8CFW7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Cc2d2aQ8CFW7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Cc2d2aQ8CFW7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Cc2d2aQ8CFW7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
Cc2d2aQ8CFW7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
Cc2d2aQ8CFW7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Cc2d2aQ8CFW7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC47.69■■■■■ 5.22
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
Cc2d2aQ8CFW7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Cc2d2aQ8CFW7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC47.63■■■■■ 5.22
Cc2d2aQ8CFW7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Cc2d2aQ8CFW7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
Cc2d2aQ8CFW7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC47.59■■■■■ 5.21
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.2
Cc2d2aQ8CFW7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC47.55■■■■■ 5.2
Cc2d2aQ8CFW7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
Cc2d2aQ8CFW7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
Cc2d2aQ8CFW7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
Cc2d2aQ8CFW7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Cc2d2aQ8CFW7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Cc2d2aQ8CFW7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
Cc2d2aQ8CFW7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
Cc2d2aQ8CFW7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
Cc2d2aQ8CFW7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.15
Cc2d2aQ8CFW7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
Cc2d2aQ8CFW7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Cc2d2aQ8CFW7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Cc2d2aQ8CFW7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
Cc2d2aQ8CFW7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC47.08■■■■■ 5.13
Cc2d2aQ8CFW7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Cc2d2aQ8CFW7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
Cc2d2aQ8CFW7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Cc2d2aQ8CFW7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Cc2d2aQ8CFW7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC47■■■■■ 5.11
Cc2d2aQ8CFW7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Cc2d2aQ8CFW7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
Cc2d2aQ8CFW7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
Cc2d2aQ8CFW7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
Cc2d2aQ8CFW7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Cc2d2aQ8CFW7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Cc2d2aQ8CFW7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
Cc2d2aQ8CFW7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Cc2d2aQ8CFW7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC46.63■■■■■ 5.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Cc2d2aQ8CFW7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Cc2d2aQ8CFW7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
Cc2d2aQ8CFW7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Cc2d2aQ8CFW7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Cc2d2aQ8CFW7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Cc2d2aQ8CFW7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
Cc2d2aQ8CFW7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
Cc2d2aQ8CFW7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Cc2d2aQ8CFW7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Cc2d2aQ8CFW7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Cc2d2aQ8CFW7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Cc2d2aQ8CFW7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
Cc2d2aQ8CFW7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Cc2d2aQ8CFW7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.98
Cc2d2aQ8CFW7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Cc2d2aQ8CFW7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
Cc2d2aQ8CFW7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC46.16■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms