Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm9955Q8CEJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm9955Q8CEJ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm9955Q8CEJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9955Q8CEJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm9955Q8CEJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm9955Q8CEJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm9955Q8CEJ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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