Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkiras1Q8CEC5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkiras1Q8CEC5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nkiras1Q8CEC5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkiras1Q8CEC5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkiras1Q8CEC5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkiras1Q8CEC5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkiras1Q8CEC5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkiras1Q8CEC5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkiras1Q8CEC5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkiras1Q8CEC5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkiras1Q8CEC5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkiras1Q8CEC5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkiras1Q8CEC5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkiras1Q8CEC5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkiras1Q8CEC5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkiras1Q8CEC5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nkiras1Q8CEC5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkiras1Q8CEC5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkiras1Q8CEC5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkiras1Q8CEC5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkiras1Q8CEC5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkiras1Q8CEC5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkiras1Q8CEC5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkiras1Q8CEC5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkiras1Q8CEC5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkiras1Q8CEC5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkiras1Q8CEC5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkiras1Q8CEC5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkiras1Q8CEC5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkiras1Q8CEC5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkiras1Q8CEC5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkiras1Q8CEC5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkiras1Q8CEC5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkiras1Q8CEC5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkiras1Q8CEC5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nkiras1Q8CEC5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkiras1Q8CEC5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkiras1Q8CEC5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms