Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD54

Piezo2, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo2Q8CD54 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Piezo2Q8CD54 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Piezo2Q8CD54 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Piezo2Q8CD54 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Piezo2Q8CD54 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Piezo2Q8CD54 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Piezo2Q8CD54 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Piezo2Q8CD54 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Piezo2Q8CD54 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Piezo2Q8CD54 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Piezo2Q8CD54 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Piezo2Q8CD54 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Piezo2Q8CD54 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Piezo2Q8CD54 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Piezo2Q8CD54 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Piezo2Q8CD54 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Piezo2Q8CD54 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Piezo2Q8CD54 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Piezo2Q8CD54 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Piezo2Q8CD54 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Piezo2Q8CD54 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Piezo2Q8CD54 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Piezo2Q8CD54 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Piezo2Q8CD54 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Piezo2Q8CD54 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Piezo2Q8CD54 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Piezo2Q8CD54 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Piezo2Q8CD54 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Piezo2Q8CD54 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Piezo2Q8CD54 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Piezo2Q8CD54 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Piezo2Q8CD54 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Piezo2Q8CD54 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Piezo2Q8CD54 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Piezo2Q8CD54 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Piezo2Q8CD54 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Piezo2Q8CD54 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Piezo2Q8CD54 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Piezo2Q8CD54 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Piezo2Q8CD54 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Piezo2Q8CD54 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Piezo2Q8CD54 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Piezo2Q8CD54 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Piezo2Q8CD54 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Piezo2Q8CD54 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Piezo2Q8CD54 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Piezo2Q8CD54 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Piezo2Q8CD54 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Piezo2Q8CD54 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Piezo2Q8CD54 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Piezo2Q8CD54 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Piezo2Q8CD54 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Piezo2Q8CD54 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Piezo2Q8CD54 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Piezo2Q8CD54 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Piezo2Q8CD54 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Piezo2Q8CD54 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Piezo2Q8CD54 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Piezo2Q8CD54 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Piezo2Q8CD54 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Piezo2Q8CD54 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Piezo2Q8CD54 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Piezo2Q8CD54 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Piezo2Q8CD54 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Piezo2Q8CD54 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Piezo2Q8CD54 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Piezo2Q8CD54 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Piezo2Q8CD54 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Piezo2Q8CD54 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Piezo2Q8CD54 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Piezo2Q8CD54 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Piezo2Q8CD54 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Piezo2Q8CD54 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Piezo2Q8CD54 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Piezo2Q8CD54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Piezo2Q8CD54 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Piezo2Q8CD54 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Piezo2Q8CD54 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Piezo2Q8CD54 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Piezo2Q8CD54 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Piezo2Q8CD54 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Piezo2Q8CD54 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Piezo2Q8CD54 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Piezo2Q8CD54 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Piezo2Q8CD54 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Piezo2Q8CD54 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Piezo2Q8CD54 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Piezo2Q8CD54 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Piezo2Q8CD54 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Piezo2Q8CD54 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Piezo2Q8CD54 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms