Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rassf4Q8CB96 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rassf4Q8CB96 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rassf4Q8CB96 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rassf4Q8CB96 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rassf4Q8CB96 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rassf4Q8CB96 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rassf4Q8CB96 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rassf4Q8CB96 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rassf4Q8CB96 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rassf4Q8CB96 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rassf4Q8CB96 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rassf4Q8CB96 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rassf4Q8CB96 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rassf4Q8CB96 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rassf4Q8CB96 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rassf4Q8CB96 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rassf4Q8CB96 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rassf4Q8CB96 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rassf4Q8CB96 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rassf4Q8CB96 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rassf4Q8CB96 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rassf4Q8CB96 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rassf4Q8CB96 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rassf4Q8CB96 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rassf4Q8CB96 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rassf4Q8CB96 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rassf4Q8CB96 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rassf4Q8CB96 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rassf4Q8CB96 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rassf4Q8CB96 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rassf4Q8CB96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rassf4Q8CB96 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rassf4Q8CB96 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rassf4Q8CB96 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rassf4Q8CB96 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rassf4Q8CB96 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rassf4Q8CB96 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rassf4Q8CB96 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rassf4Q8CB96 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rassf4Q8CB96 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rassf4Q8CB96 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rassf4Q8CB96 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rassf4Q8CB96 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rassf4Q8CB96 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rassf4Q8CB96 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rassf4Q8CB96 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rassf4Q8CB96 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rassf4Q8CB96 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rassf4Q8CB96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rassf4Q8CB96 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rassf4Q8CB96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rassf4Q8CB96 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rassf4Q8CB96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rassf4Q8CB96 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rassf4Q8CB96 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rassf4Q8CB96 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rassf4Q8CB96 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rassf4Q8CB96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rassf4Q8CB96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rassf4Q8CB96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rassf4Q8CB96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rassf4Q8CB96 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rassf4Q8CB96 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rassf4Q8CB96 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rassf4Q8CB96 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rassf4Q8CB96 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rassf4Q8CB96 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms