Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppfibp1Q8C8U0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppfibp1Q8C8U0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppfibp1Q8C8U0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppfibp1Q8C8U0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppfibp1Q8C8U0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppfibp1Q8C8U0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppfibp1Q8C8U0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppfibp1Q8C8U0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppfibp1Q8C8U0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppfibp1Q8C8U0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppfibp1Q8C8U0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppfibp1Q8C8U0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppfibp1Q8C8U0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppfibp1Q8C8U0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ppfibp1Q8C8U0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppfibp1Q8C8U0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppfibp1Q8C8U0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppfibp1Q8C8U0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppfibp1Q8C8U0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppfibp1Q8C8U0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppfibp1Q8C8U0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppfibp1Q8C8U0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppfibp1Q8C8U0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppfibp1Q8C8U0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppfibp1Q8C8U0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppfibp1Q8C8U0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppfibp1Q8C8U0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppfibp1Q8C8U0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppfibp1Q8C8U0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppfibp1Q8C8U0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppfibp1Q8C8U0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppfibp1Q8C8U0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppfibp1Q8C8U0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppfibp1Q8C8U0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppfibp1Q8C8U0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppfibp1Q8C8U0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppfibp1Q8C8U0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppfibp1Q8C8U0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppfibp1Q8C8U0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppfibp1Q8C8U0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppfibp1Q8C8U0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppfibp1Q8C8U0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppfibp1Q8C8U0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppfibp1Q8C8U0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfibp1Q8C8U0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppfibp1Q8C8U0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms