Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apoa5Q8C7G5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apoa5Q8C7G5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apoa5Q8C7G5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apoa5Q8C7G5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apoa5Q8C7G5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apoa5Q8C7G5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Apoa5Q8C7G5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Apoa5Q8C7G5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apoa5Q8C7G5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apoa5Q8C7G5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apoa5Q8C7G5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apoa5Q8C7G5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apoa5Q8C7G5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apoa5Q8C7G5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apoa5Q8C7G5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apoa5Q8C7G5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apoa5Q8C7G5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apoa5Q8C7G5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apoa5Q8C7G5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apoa5Q8C7G5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apoa5Q8C7G5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apoa5Q8C7G5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apoa5Q8C7G5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apoa5Q8C7G5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apoa5Q8C7G5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoa5Q8C7G5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoa5Q8C7G5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apoa5Q8C7G5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoa5Q8C7G5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apoa5Q8C7G5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Apoa5Q8C7G5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apoa5Q8C7G5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apoa5Q8C7G5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apoa5Q8C7G5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apoa5Q8C7G5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apoa5Q8C7G5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apoa5Q8C7G5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoa5Q8C7G5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apoa5Q8C7G5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apoa5Q8C7G5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apoa5Q8C7G5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apoa5Q8C7G5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apoa5Q8C7G5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apoa5Q8C7G5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apoa5Q8C7G5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Apoa5Q8C7G5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apoa5Q8C7G5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoa5Q8C7G5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoa5Q8C7G5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoa5Q8C7G5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa5Q8C7G5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apoa5Q8C7G5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoa5Q8C7G5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apoa5Q8C7G5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apoa5Q8C7G5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apoa5Q8C7G5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apoa5Q8C7G5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Apoa5Q8C7G5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apoa5Q8C7G5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apoa5Q8C7G5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms