Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXK9

Clic5, Chloride intracellular channel protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic5Q8BXK9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic5Q8BXK9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic5Q8BXK9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic5Q8BXK9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic5Q8BXK9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic5Q8BXK9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic5Q8BXK9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clic5Q8BXK9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic5Q8BXK9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic5Q8BXK9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic5Q8BXK9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic5Q8BXK9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic5Q8BXK9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clic5Q8BXK9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic5Q8BXK9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic5Q8BXK9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic5Q8BXK9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic5Q8BXK9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clic5Q8BXK9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clic5Q8BXK9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clic5Q8BXK9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clic5Q8BXK9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clic5Q8BXK9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clic5Q8BXK9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clic5Q8BXK9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic5Q8BXK9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clic5Q8BXK9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clic5Q8BXK9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clic5Q8BXK9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clic5Q8BXK9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clic5Q8BXK9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clic5Q8BXK9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clic5Q8BXK9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clic5Q8BXK9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clic5Q8BXK9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clic5Q8BXK9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Clic5Q8BXK9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clic5Q8BXK9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clic5Q8BXK9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clic5Q8BXK9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clic5Q8BXK9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clic5Q8BXK9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clic5Q8BXK9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clic5Q8BXK9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clic5Q8BXK9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clic5Q8BXK9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clic5Q8BXK9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clic5Q8BXK9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clic5Q8BXK9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clic5Q8BXK9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clic5Q8BXK9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clic5Q8BXK9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clic5Q8BXK9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clic5Q8BXK9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clic5Q8BXK9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clic5Q8BXK9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clic5Q8BXK9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms