Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Snx17Q8BVL3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snx17Q8BVL3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snx17Q8BVL3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snx17Q8BVL3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snx17Q8BVL3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snx17Q8BVL3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Snx17Q8BVL3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Snx17Q8BVL3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snx17Q8BVL3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Snx17Q8BVL3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snx17Q8BVL3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snx17Q8BVL3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snx17Q8BVL3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx17Q8BVL3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx17Q8BVL3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx17Q8BVL3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx17Q8BVL3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Snx17Q8BVL3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Snx17Q8BVL3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snx17Q8BVL3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snx17Q8BVL3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Snx17Q8BVL3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Snx17Q8BVL3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snx17Q8BVL3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snx17Q8BVL3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snx17Q8BVL3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snx17Q8BVL3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snx17Q8BVL3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snx17Q8BVL3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snx17Q8BVL3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snx17Q8BVL3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snx17Q8BVL3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snx17Q8BVL3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snx17Q8BVL3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snx17Q8BVL3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snx17Q8BVL3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snx17Q8BVL3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snx17Q8BVL3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Snx17Q8BVL3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Snx17Q8BVL3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Snx17Q8BVL3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Snx17Q8BVL3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Snx17Q8BVL3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snx17Q8BVL3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snx17Q8BVL3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snx17Q8BVL3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Snx17Q8BVL3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Snx17Q8BVL3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Snx17Q8BVL3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snx17Q8BVL3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snx17Q8BVL3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snx17Q8BVL3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snx17Q8BVL3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Snx17Q8BVL3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snx17Q8BVL3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snx17Q8BVL3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snx17Q8BVL3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Snx17Q8BVL3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snx17Q8BVL3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snx17Q8BVL3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snx17Q8BVL3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Snx17Q8BVL3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Snx17Q8BVL3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snx17Q8BVL3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snx17Q8BVL3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Snx17Q8BVL3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Snx17Q8BVL3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snx17Q8BVL3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snx17Q8BVL3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snx17Q8BVL3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snx17Q8BVL3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snx17Q8BVL3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snx17Q8BVL3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snx17Q8BVL3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Snx17Q8BVL3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snx17Q8BVL3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snx17Q8BVL3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snx17Q8BVL3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snx17Q8BVL3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snx17Q8BVL3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snx17Q8BVL3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snx17Q8BVL3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snx17Q8BVL3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
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