Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730596B20RikQ8BQ08 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
5730596B20RikQ8BQ08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
5730596B20RikQ8BQ08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5730596B20RikQ8BQ08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms