Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarcal1Q8BJL0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarcal1Q8BJL0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarcal1Q8BJL0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarcal1Q8BJL0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarcal1Q8BJL0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarcal1Q8BJL0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarcal1Q8BJL0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarcal1Q8BJL0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarcal1Q8BJL0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarcal1Q8BJL0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarcal1Q8BJL0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarcal1Q8BJL0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarcal1Q8BJL0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarcal1Q8BJL0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarcal1Q8BJL0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarcal1Q8BJL0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarcal1Q8BJL0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarcal1Q8BJL0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarcal1Q8BJL0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarcal1Q8BJL0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarcal1Q8BJL0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarcal1Q8BJL0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarcal1Q8BJL0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarcal1Q8BJL0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarcal1Q8BJL0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarcal1Q8BJL0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarcal1Q8BJL0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarcal1Q8BJL0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarcal1Q8BJL0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcal1Q8BJL0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarcal1Q8BJL0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarcal1Q8BJL0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcal1Q8BJL0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcal1Q8BJL0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcal1Q8BJL0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarcal1Q8BJL0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcal1Q8BJL0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcal1Q8BJL0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcal1Q8BJL0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcal1Q8BJL0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarcal1Q8BJL0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcal1Q8BJL0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarcal1Q8BJL0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarcal1Q8BJL0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarcal1Q8BJL0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smarcal1Q8BJL0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcal1Q8BJL0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarcal1Q8BJL0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcal1Q8BJL0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarcal1Q8BJL0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcal1Q8BJL0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcal1Q8BJL0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarcal1Q8BJL0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarcal1Q8BJL0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarcal1Q8BJL0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarcal1Q8BJL0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarcal1Q8BJL0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarcal1Q8BJL0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarcal1Q8BJL0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarcal1Q8BJL0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarcal1Q8BJL0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarcal1Q8BJL0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarcal1Q8BJL0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarcal1Q8BJL0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarcal1Q8BJL0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarcal1Q8BJL0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarcal1Q8BJL0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcal1Q8BJL0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcal1Q8BJL0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcal1Q8BJL0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms