Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rspo4Q8BJ73 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rspo4Q8BJ73 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rspo4Q8BJ73 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rspo4Q8BJ73 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rspo4Q8BJ73 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rspo4Q8BJ73 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rspo4Q8BJ73 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rspo4Q8BJ73 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rspo4Q8BJ73 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rspo4Q8BJ73 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rspo4Q8BJ73 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rspo4Q8BJ73 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rspo4Q8BJ73 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rspo4Q8BJ73 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rspo4Q8BJ73 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rspo4Q8BJ73 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rspo4Q8BJ73 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rspo4Q8BJ73 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rspo4Q8BJ73 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rspo4Q8BJ73 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rspo4Q8BJ73 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rspo4Q8BJ73 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rspo4Q8BJ73 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rspo4Q8BJ73 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rspo4Q8BJ73 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rspo4Q8BJ73 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rspo4Q8BJ73 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rspo4Q8BJ73 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rspo4Q8BJ73 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rspo4Q8BJ73 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rspo4Q8BJ73 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rspo4Q8BJ73 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rspo4Q8BJ73 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rspo4Q8BJ73 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rspo4Q8BJ73 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rspo4Q8BJ73 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rspo4Q8BJ73 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rspo4Q8BJ73 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rspo4Q8BJ73 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rspo4Q8BJ73 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rspo4Q8BJ73 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rspo4Q8BJ73 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rspo4Q8BJ73 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rspo4Q8BJ73 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rspo4Q8BJ73 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rspo4Q8BJ73 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rspo4Q8BJ73 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rspo4Q8BJ73 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rspo4Q8BJ73 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rspo4Q8BJ73 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rspo4Q8BJ73 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rspo4Q8BJ73 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rspo4Q8BJ73 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rspo4Q8BJ73 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rspo4Q8BJ73 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rspo4Q8BJ73 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rspo4Q8BJ73 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rspo4Q8BJ73 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rspo4Q8BJ73 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rspo4Q8BJ73 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rspo4Q8BJ73 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rspo4Q8BJ73 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rspo4Q8BJ73 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rspo4Q8BJ73 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rspo4Q8BJ73 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rspo4Q8BJ73 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rspo4Q8BJ73 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rspo4Q8BJ73 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rspo4Q8BJ73 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rspo4Q8BJ73 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rspo4Q8BJ73 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rspo4Q8BJ73 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rspo4Q8BJ73 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rspo4Q8BJ73 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rspo4Q8BJ73 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rspo4Q8BJ73 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rspo4Q8BJ73 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rspo4Q8BJ73 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rspo4Q8BJ73 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rspo4Q8BJ73 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rspo4Q8BJ73 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms