Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cracr2bQ80ZJ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Cracr2bQ80ZJ8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Cracr2bQ80ZJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Cracr2bQ80ZJ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Cracr2bQ80ZJ8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cracr2bQ80ZJ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cracr2bQ80ZJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Cracr2bQ80ZJ8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Cracr2bQ80ZJ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Cracr2bQ80ZJ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Cracr2bQ80ZJ8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Cracr2bQ80ZJ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cracr2bQ80ZJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cracr2bQ80ZJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cracr2bQ80ZJ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cracr2bQ80ZJ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cracr2bQ80ZJ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cracr2bQ80ZJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cracr2bQ80ZJ8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cracr2bQ80ZJ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Cracr2bQ80ZJ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Cracr2bQ80ZJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Cracr2bQ80ZJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Cracr2bQ80ZJ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Cracr2bQ80ZJ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Cracr2bQ80ZJ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cracr2bQ80ZJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cracr2bQ80ZJ8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cracr2bQ80ZJ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cracr2bQ80ZJ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cracr2bQ80ZJ8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Cracr2bQ80ZJ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cracr2bQ80ZJ8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cracr2bQ80ZJ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Cracr2bQ80ZJ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cracr2bQ80ZJ8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Cracr2bQ80ZJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Cracr2bQ80ZJ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Cracr2bQ80ZJ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Cracr2bQ80ZJ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cracr2bQ80ZJ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cracr2bQ80ZJ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cracr2bQ80ZJ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cracr2bQ80ZJ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cracr2bQ80ZJ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cracr2bQ80ZJ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cracr2bQ80ZJ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cracr2bQ80ZJ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cracr2bQ80ZJ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cracr2bQ80ZJ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cracr2bQ80ZJ8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cracr2bQ80ZJ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cracr2bQ80ZJ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Cracr2bQ80ZJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms