Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hapln4Q80WM4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hapln4Q80WM4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hapln4Q80WM4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hapln4Q80WM4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hapln4Q80WM4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hapln4Q80WM4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hapln4Q80WM4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hapln4Q80WM4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hapln4Q80WM4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hapln4Q80WM4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hapln4Q80WM4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hapln4Q80WM4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hapln4Q80WM4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hapln4Q80WM4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hapln4Q80WM4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hapln4Q80WM4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hapln4Q80WM4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hapln4Q80WM4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hapln4Q80WM4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hapln4Q80WM4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hapln4Q80WM4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hapln4Q80WM4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hapln4Q80WM4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hapln4Q80WM4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hapln4Q80WM4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hapln4Q80WM4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hapln4Q80WM4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hapln4Q80WM4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hapln4Q80WM4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hapln4Q80WM4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hapln4Q80WM4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hapln4Q80WM4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hapln4Q80WM4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hapln4Q80WM4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hapln4Q80WM4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hapln4Q80WM4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hapln4Q80WM4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hapln4Q80WM4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hapln4Q80WM4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hapln4Q80WM4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hapln4Q80WM4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hapln4Q80WM4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hapln4Q80WM4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hapln4Q80WM4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hapln4Q80WM4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hapln4Q80WM4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hapln4Q80WM4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hapln4Q80WM4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hapln4Q80WM4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hapln4Q80WM4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hapln4Q80WM4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hapln4Q80WM4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hapln4Q80WM4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hapln4Q80WM4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hapln4Q80WM4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms