Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Plxna4Q80UG2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Plxna4Q80UG2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Plxna4Q80UG2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plxna4Q80UG2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Plxna4Q80UG2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Plxna4Q80UG2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Plxna4Q80UG2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Plxna4Q80UG2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Plxna4Q80UG2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Plxna4Q80UG2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Plxna4Q80UG2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Plxna4Q80UG2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Plxna4Q80UG2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Plxna4Q80UG2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Plxna4Q80UG2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Plxna4Q80UG2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Plxna4Q80UG2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Plxna4Q80UG2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Plxna4Q80UG2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Plxna4Q80UG2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Plxna4Q80UG2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Plxna4Q80UG2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Plxna4Q80UG2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Plxna4Q80UG2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,89■■■□□ 2,05
Plxna4Q80UG2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Plxna4Q80UG2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Plxna4Q80UG2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Plxna4Q80UG2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Plxna4Q80UG2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Plxna4Q80UG2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Plxna4Q80UG2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Plxna4Q80UG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Plxna4Q80UG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Plxna4Q80UG2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Plxna4Q80UG2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Plxna4Q80UG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Plxna4Q80UG2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Plxna4Q80UG2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Plxna4Q80UG2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Plxna4Q80UG2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Plxna4Q80UG2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Plxna4Q80UG2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Plxna4Q80UG2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Plxna4Q80UG2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Plxna4Q80UG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Plxna4Q80UG2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Plxna4Q80UG2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Plxna4Q80UG2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Plxna4Q80UG2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Plxna4Q80UG2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Plxna4Q80UG2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Plxna4Q80UG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Plxna4Q80UG2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Plxna4Q80UG2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,55■■■□□ 2
Plxna4Q80UG2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Plxna4Q80UG2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Plxna4Q80UG2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Plxna4Q80UG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Plxna4Q80UG2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Plxna4Q80UG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Plxna4Q80UG2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Plxna4Q80UG2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Plxna4Q80UG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Plxna4Q80UG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Plxna4Q80UG2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,39■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Plxna4Q80UG2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Plxna4Q80UG2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Plxna4Q80UG2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Plxna4Q80UG2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Plxna4Q80UG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms