Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf516Q7TSH3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf516Q7TSH3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf516Q7TSH3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf516Q7TSH3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf516Q7TSH3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf516Q7TSH3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf516Q7TSH3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf516Q7TSH3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf516Q7TSH3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf516Q7TSH3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf516Q7TSH3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf516Q7TSH3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf516Q7TSH3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf516Q7TSH3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf516Q7TSH3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf516Q7TSH3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf516Q7TSH3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf516Q7TSH3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf516Q7TSH3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf516Q7TSH3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf516Q7TSH3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf516Q7TSH3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf516Q7TSH3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf516Q7TSH3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf516Q7TSH3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf516Q7TSH3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf516Q7TSH3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf516Q7TSH3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf516Q7TSH3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf516Q7TSH3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf516Q7TSH3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf516Q7TSH3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf516Q7TSH3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf516Q7TSH3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf516Q7TSH3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf516Q7TSH3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf516Q7TSH3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf516Q7TSH3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf516Q7TSH3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf516Q7TSH3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf516Q7TSH3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf516Q7TSH3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf516Q7TSH3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf516Q7TSH3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf516Q7TSH3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Znf516Q7TSH3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf516Q7TSH3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf516Q7TSH3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf516Q7TSH3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf516Q7TSH3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf516Q7TSH3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf516Q7TSH3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf516Q7TSH3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf516Q7TSH3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf516Q7TSH3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf516Q7TSH3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms