Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Usp34Q6ZQ93 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Usp34Q6ZQ93 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Usp34Q6ZQ93 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Usp34Q6ZQ93 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Usp34Q6ZQ93 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Usp34Q6ZQ93 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Usp34Q6ZQ93 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Usp34Q6ZQ93 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Usp34Q6ZQ93 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Usp34Q6ZQ93 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Usp34Q6ZQ93 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Usp34Q6ZQ93 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Usp34Q6ZQ93 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Usp34Q6ZQ93 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31,44■■■□□ 2,62
Usp34Q6ZQ93 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Usp34Q6ZQ93 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Usp34Q6ZQ93 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Usp34Q6ZQ93 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Usp34Q6ZQ93 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Usp34Q6ZQ93 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Usp34Q6ZQ93 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Usp34Q6ZQ93 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,61
Usp34Q6ZQ93 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Usp34Q6ZQ93 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Usp34Q6ZQ93 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Usp34Q6ZQ93 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Usp34Q6ZQ93 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Usp34Q6ZQ93 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Usp34Q6ZQ93 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Usp34Q6ZQ93 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Usp34Q6ZQ93 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31,2■■■□□ 2,58
Usp34Q6ZQ93 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Usp34Q6ZQ93 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Usp34Q6ZQ93 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Usp34Q6ZQ93 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Usp34Q6ZQ93 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Usp34Q6ZQ93 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Usp34Q6ZQ93 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Usp34Q6ZQ93 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Usp34Q6ZQ93 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Usp34Q6ZQ93 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Usp34Q6ZQ93 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Usp34Q6ZQ93 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Usp34Q6ZQ93 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Usp34Q6ZQ93 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Usp34Q6ZQ93 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Usp34Q6ZQ93 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Usp34Q6ZQ93 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Usp34Q6ZQ93 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Usp34Q6ZQ93 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Usp34Q6ZQ93 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,53
Usp34Q6ZQ93 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Usp34Q6ZQ93 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Usp34Q6ZQ93 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Usp34Q6ZQ93 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Usp34Q6ZQ93 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Usp34Q6ZQ93 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Usp34Q6ZQ93 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Usp34Q6ZQ93 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Usp34Q6ZQ93 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Usp34Q6ZQ93 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
Usp34Q6ZQ93 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Usp34Q6ZQ93 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Usp34Q6ZQ93 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Usp34Q6ZQ93 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Usp34Q6ZQ93 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Usp34Q6ZQ93 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Usp34Q6ZQ93 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Usp34Q6ZQ93 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Usp34Q6ZQ93 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Usp34Q6ZQ93 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Usp34Q6ZQ93 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Usp34Q6ZQ93 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Usp34Q6ZQ93 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Usp34Q6ZQ93 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Usp34Q6ZQ93 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Usp34Q6ZQ93 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Usp34Q6ZQ93 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Usp34Q6ZQ93 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Usp34Q6ZQ93 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Usp34Q6ZQ93 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Usp34Q6ZQ93 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Usp34Q6ZQ93 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Usp34Q6ZQ93 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Usp34Q6ZQ93 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Usp34Q6ZQ93 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Usp34Q6ZQ93 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Usp34Q6ZQ93 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Usp34Q6ZQ93 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30,39■■■□□ 2,45
Usp34Q6ZQ93 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Usp34Q6ZQ93 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Usp34Q6ZQ93 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Usp34Q6ZQ93 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Usp34Q6ZQ93 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Usp34Q6ZQ93 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Usp34Q6ZQ93 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Usp34Q6ZQ93 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Usp34Q6ZQ93 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Usp34Q6ZQ93 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms