Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPQ6

Pitpnm2, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pitpnm2Q6ZPQ6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pitpnm2Q6ZPQ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pitpnm2Q6ZPQ6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pitpnm2Q6ZPQ6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pitpnm2Q6ZPQ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pitpnm2Q6ZPQ6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pitpnm2Q6ZPQ6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pitpnm2Q6ZPQ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pitpnm2Q6ZPQ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pitpnm2Q6ZPQ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pitpnm2Q6ZPQ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pitpnm2Q6ZPQ6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pitpnm2Q6ZPQ6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pitpnm2Q6ZPQ6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pitpnm2Q6ZPQ6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pitpnm2Q6ZPQ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pitpnm2Q6ZPQ6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pitpnm2Q6ZPQ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pitpnm2Q6ZPQ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pitpnm2Q6ZPQ6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pitpnm2Q6ZPQ6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pitpnm2Q6ZPQ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Pitpnm2Q6ZPQ6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pitpnm2Q6ZPQ6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pitpnm2Q6ZPQ6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pitpnm2Q6ZPQ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pitpnm2Q6ZPQ6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pitpnm2Q6ZPQ6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pitpnm2Q6ZPQ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pitpnm2Q6ZPQ6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pitpnm2Q6ZPQ6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pitpnm2Q6ZPQ6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pitpnm2Q6ZPQ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pitpnm2Q6ZPQ6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pitpnm2Q6ZPQ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.4 ms