Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tcaf3Q6QR59 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tcaf3Q6QR59 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tcaf3Q6QR59 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tcaf3Q6QR59 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tcaf3Q6QR59 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tcaf3Q6QR59 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tcaf3Q6QR59 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tcaf3Q6QR59 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcaf3Q6QR59 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcaf3Q6QR59 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcaf3Q6QR59 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcaf3Q6QR59 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcaf3Q6QR59 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Tcaf3Q6QR59 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tcaf3Q6QR59 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tcaf3Q6QR59 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcaf3Q6QR59 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcaf3Q6QR59 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tcaf3Q6QR59 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcaf3Q6QR59 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcaf3Q6QR59 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcaf3Q6QR59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tcaf3Q6QR59 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcaf3Q6QR59 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcaf3Q6QR59 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tcaf3Q6QR59 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tcaf3Q6QR59 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tcaf3Q6QR59 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tcaf3Q6QR59 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tcaf3Q6QR59 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tcaf3Q6QR59 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tcaf3Q6QR59 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tcaf3Q6QR59 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tcaf3Q6QR59 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tcaf3Q6QR59 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tcaf3Q6QR59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tcaf3Q6QR59 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tcaf3Q6QR59 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tcaf3Q6QR59 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Tcaf3Q6QR59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tcaf3Q6QR59 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tcaf3Q6QR59 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tcaf3Q6QR59 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tcaf3Q6QR59 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tcaf3Q6QR59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tcaf3Q6QR59 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tcaf3Q6QR59 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tcaf3Q6QR59 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tcaf3Q6QR59 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tcaf3Q6QR59 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tcaf3Q6QR59 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tcaf3Q6QR59 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tcaf3Q6QR59 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tcaf3Q6QR59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcaf3Q6QR59 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcaf3Q6QR59 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcaf3Q6QR59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tcaf3Q6QR59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tcaf3Q6QR59 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tcaf3Q6QR59 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tcaf3Q6QR59 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tcaf3Q6QR59 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tcaf3Q6QR59 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tcaf3Q6QR59 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tcaf3Q6QR59 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tcaf3Q6QR59 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tcaf3Q6QR59 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tcaf3Q6QR59 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tcaf3Q6QR59 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tcaf3Q6QR59 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tcaf3Q6QR59 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tcaf3Q6QR59 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tcaf3Q6QR59 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms