Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpa4Q6P8K8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cpa4Q6P8K8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpa4Q6P8K8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpa4Q6P8K8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpa4Q6P8K8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cpa4Q6P8K8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cpa4Q6P8K8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cpa4Q6P8K8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpa4Q6P8K8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cpa4Q6P8K8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpa4Q6P8K8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpa4Q6P8K8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cpa4Q6P8K8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cpa4Q6P8K8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cpa4Q6P8K8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cpa4Q6P8K8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpa4Q6P8K8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cpa4Q6P8K8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cpa4Q6P8K8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cpa4Q6P8K8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cpa4Q6P8K8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpa4Q6P8K8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpa4Q6P8K8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cpa4Q6P8K8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cpa4Q6P8K8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpa4Q6P8K8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cpa4Q6P8K8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cpa4Q6P8K8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpa4Q6P8K8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpa4Q6P8K8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cpa4Q6P8K8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpa4Q6P8K8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpa4Q6P8K8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cpa4Q6P8K8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cpa4Q6P8K8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cpa4Q6P8K8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cpa4Q6P8K8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cpa4Q6P8K8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cpa4Q6P8K8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cpa4Q6P8K8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cpa4Q6P8K8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cpa4Q6P8K8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cpa4Q6P8K8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cpa4Q6P8K8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cpa4Q6P8K8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cpa4Q6P8K8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cpa4Q6P8K8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cpa4Q6P8K8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpa4Q6P8K8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpa4Q6P8K8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpa4Q6P8K8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpa4Q6P8K8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpa4Q6P8K8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cpa4Q6P8K8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cpa4Q6P8K8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms