Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Paxip1Q6NZQ4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Paxip1Q6NZQ4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Paxip1Q6NZQ4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Paxip1Q6NZQ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Paxip1Q6NZQ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Paxip1Q6NZQ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Paxip1Q6NZQ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Paxip1Q6NZQ4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Paxip1Q6NZQ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Paxip1Q6NZQ4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Paxip1Q6NZQ4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Paxip1Q6NZQ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Paxip1Q6NZQ4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Paxip1Q6NZQ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Paxip1Q6NZQ4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Paxip1Q6NZQ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Paxip1Q6NZQ4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Paxip1Q6NZQ4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Paxip1Q6NZQ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Paxip1Q6NZQ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Paxip1Q6NZQ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Paxip1Q6NZQ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Paxip1Q6NZQ4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Paxip1Q6NZQ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Paxip1Q6NZQ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Paxip1Q6NZQ4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Paxip1Q6NZQ4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Paxip1Q6NZQ4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Paxip1Q6NZQ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Paxip1Q6NZQ4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Paxip1Q6NZQ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Paxip1Q6NZQ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Paxip1Q6NZQ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Paxip1Q6NZQ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Paxip1Q6NZQ4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Paxip1Q6NZQ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Paxip1Q6NZQ4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Paxip1Q6NZQ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Paxip1Q6NZQ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Paxip1Q6NZQ4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Paxip1Q6NZQ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Paxip1Q6NZQ4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Paxip1Q6NZQ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Paxip1Q6NZQ4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Paxip1Q6NZQ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Paxip1Q6NZQ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Paxip1Q6NZQ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Paxip1Q6NZQ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Paxip1Q6NZQ4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Paxip1Q6NZQ4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Paxip1Q6NZQ4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Paxip1Q6NZQ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Paxip1Q6NZQ4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Paxip1Q6NZQ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Paxip1Q6NZQ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Paxip1Q6NZQ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Paxip1Q6NZQ4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Paxip1Q6NZQ4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Paxip1Q6NZQ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Paxip1Q6NZQ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Paxip1Q6NZQ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms