Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL8

Scube1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube1Q6NZL8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scube1Q6NZL8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scube1Q6NZL8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scube1Q6NZL8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scube1Q6NZL8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scube1Q6NZL8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scube1Q6NZL8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scube1Q6NZL8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scube1Q6NZL8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scube1Q6NZL8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scube1Q6NZL8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scube1Q6NZL8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scube1Q6NZL8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scube1Q6NZL8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scube1Q6NZL8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scube1Q6NZL8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scube1Q6NZL8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scube1Q6NZL8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scube1Q6NZL8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scube1Q6NZL8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scube1Q6NZL8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scube1Q6NZL8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scube1Q6NZL8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scube1Q6NZL8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scube1Q6NZL8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scube1Q6NZL8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scube1Q6NZL8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scube1Q6NZL8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scube1Q6NZL8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scube1Q6NZL8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scube1Q6NZL8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scube1Q6NZL8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scube1Q6NZL8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scube1Q6NZL8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scube1Q6NZL8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scube1Q6NZL8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scube1Q6NZL8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scube1Q6NZL8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scube1Q6NZL8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scube1Q6NZL8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scube1Q6NZL8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scube1Q6NZL8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scube1Q6NZL8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scube1Q6NZL8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scube1Q6NZL8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scube1Q6NZL8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scube1Q6NZL8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scube1Q6NZL8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scube1Q6NZL8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scube1Q6NZL8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms